MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 15492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	GAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
2	NC_007798	ATA	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608392
3	NC_007798	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608392
4	NC_007798	AGA	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
5	NC_007798	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608392
6	NC_007798	CTTT	2	8	430	437	0 %	75 %	0 %	25 %	88608392
7	NC_007798	AGA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
8	NC_007798	GC	3	6	589	594	0 %	0 %	50 %	50 %	88608392
9	NC_007798	A	8	8	595	602	100 %	0 %	0 %	0 %	88608392
10	NC_007798	TATG	2	8	635	642	25 %	50 %	25 %	0 %	88608392
11	NC_007798	A	9	9	647	655	100 %	0 %	0 %	0 %	88608392
12	NC_007798	AG	3	6	660	665	50 %	0 %	50 %	0 %	88608392
13	NC_007798	AG	3	6	759	764	50 %	0 %	50 %	0 %	88608392
14	NC_007798	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608502
15	NC_007798	TAC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608502
16	NC_007798	TCT	2	6	930	935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
17	NC_007798	AAC	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608502
18	NC_007798	GC	3	6	1074	1079	0 %	0 %	50 %	50 %	88608502
19	NC_007798	CCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88608502
20	NC_007798	AGG	3	9	1148	1156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608502
21	NC_007798	CAT	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608502
22	NC_007798	GAC	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608502
23	NC_007798	TGT	2	6	1343	1348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608502
24	NC_007798	AGTT	2	8	1453	1460	25 %	50 %	25 %	0 %	88608502
25	NC_007798	T	7	7	1508	1514	0 %	100 %	0 %	0 %	88608502
26	NC_007798	T	6	6	1516	1521	0 %	100 %	0 %	0 %	88608502
27	NC_007798	T	9	9	1526	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	88608502
28	NC_007798	AAAAG	2	10	1575	1584	80 %	0 %	20 %	0 %	88608502
29	NC_007798	CTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
30	NC_007798	A	6	6	1692	1697	100 %	0 %	0 %	0 %	88608502
31	NC_007798	GAGAA	2	10	1740	1749	60 %	0 %	40 %	0 %	88608502
32	NC_007798	A	6	6	1760	1765	100 %	0 %	0 %	0 %	88608502
33	NC_007798	TCT	2	6	1811	1816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
34	NC_007798	GTT	2	6	1846	1851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608502
35	NC_007798	GAT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608502
36	NC_007798	AGG	2	6	1984	1989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608502
37	NC_007798	AG	3	6	2066	2071	50 %	0 %	50 %	0 %	88608502
38	NC_007798	TAG	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608502
39	NC_007798	A	6	6	2091	2096	100 %	0 %	0 %	0 %	88608502
40	NC_007798	GCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88608550
41	NC_007798	ACG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608550
42	NC_007798	CCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608550
43	NC_007798	CGT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
44	NC_007798	AG	3	6	2414	2419	50 %	0 %	50 %	0 %	88608550
45	NC_007798	ATTTCA	2	12	2466	2477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88608550
46	NC_007798	TTA	2	6	2509	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608550
47	NC_007798	TCTTT	2	10	2637	2646	0 %	80 %	0 %	20 %	88608550
48	NC_007798	GTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
49	NC_007798	GTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
50	NC_007798	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608550
51	NC_007798	CTG	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
52	NC_007798	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608550
53	NC_007798	TCT	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608550
54	NC_007798	CTTT	2	8	2940	2947	0 %	75 %	0 %	25 %	88608550
55	NC_007798	T	7	7	2951	2957	0 %	100 %	0 %	0 %	88608550
56	NC_007798	GTTC	2	8	2980	2987	0 %	50 %	25 %	25 %	88608550
57	NC_007798	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608550
58	NC_007798	ACT	2	6	3168	3173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608550
59	NC_007798	GAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608550
60	NC_007798	TTG	2	6	3258	3263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
61	NC_007798	CTTCG	2	10	3335	3344	0 %	40 %	20 %	40 %	88608550
62	NC_007798	CT	3	6	3471	3476	0 %	50 %	0 %	50 %	88608550
63	NC_007798	TGC	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
64	NC_007798	T	6	6	3496	3501	0 %	100 %	0 %	0 %	88608550
65	NC_007798	TA	3	6	3509	3514	50 %	50 %	0 %	0 %	88608550
66	NC_007798	AGT	2	6	3531	3536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608550
67	NC_007798	TA	3	6	3566	3571	50 %	50 %	0 %	0 %	88608550
68	NC_007798	GTA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608480
69	NC_007798	GGGA	2	8	3662	3669	25 %	0 %	75 %	0 %	88608480
70	NC_007798	T	6	6	3677	3682	0 %	100 %	0 %	0 %	88608480
71	NC_007798	GAA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
72	NC_007798	TGGA	2	8	3869	3876	25 %	25 %	50 %	0 %	88608480
73	NC_007798	ATAG	2	8	3882	3889	50 %	25 %	25 %	0 %	88608480
74	NC_007798	A	7	7	3920	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	88608480
75	NC_007798	T	8	8	3944	3951	0 %	100 %	0 %	0 %	88608480
76	NC_007798	A	6	6	3974	3979	100 %	0 %	0 %	0 %	88608480
77	NC_007798	CT	3	6	3997	4002	0 %	50 %	0 %	50 %	88608480
78	NC_007798	CA	3	6	4106	4111	50 %	0 %	0 %	50 %	88608480
79	NC_007798	AATTT	2	10	4140	4149	40 %	60 %	0 %	0 %	88608480
80	NC_007798	GAA	2	6	4153	4158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
81	NC_007798	A	7	7	4209	4215	100 %	0 %	0 %	0 %	88608480
82	NC_007798	T	8	8	4247	4254	0 %	100 %	0 %	0 %	88608480
83	NC_007798	AGAT	2	8	4273	4280	50 %	25 %	25 %	0 %	88608480
84	NC_007798	AAG	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
85	NC_007798	TCA	2	6	4314	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608480
86	NC_007798	TTG	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608480
87	NC_007798	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608480
88	NC_007798	TAA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608480
89	NC_007798	A	6	6	4575	4580	100 %	0 %	0 %	0 %	88608480
90	NC_007798	GA	3	6	4665	4670	50 %	0 %	50 %	0 %	88608480
91	NC_007798	ATTT	2	8	4681	4688	25 %	75 %	0 %	0 %	88608480
92	NC_007798	ATT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608480
93	NC_007798	T	6	6	4860	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	88608480
94	NC_007798	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608480
95	NC_007798	GAC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608480
96	NC_007798	ACT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608833
97	NC_007798	GA	3	6	4991	4996	50 %	0 %	50 %	0 %	88608833
98	NC_007798	TGA	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
99	NC_007798	C	6	6	5019	5024	0 %	0 %	0 %	100 %	88608833
100	NC_007798	T	6	6	5027	5032	0 %	100 %	0 %	0 %	88608833
101	NC_007798	ACA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608833
102	NC_007798	T	7	7	5131	5137	0 %	100 %	0 %	0 %	88608833
103	NC_007798	T	6	6	5159	5164	0 %	100 %	0 %	0 %	88608833
104	NC_007798	CT	3	6	5232	5237	0 %	50 %	0 %	50 %	88608833
105	NC_007798	T	6	6	5245	5250	0 %	100 %	0 %	0 %	88608833
106	NC_007798	GT	3	6	5251	5256	0 %	50 %	50 %	0 %	88608833
107	NC_007798	GTA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
108	NC_007798	TGG	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608833
109	NC_007798	GAT	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
110	NC_007798	CT	3	6	5547	5552	0 %	50 %	0 %	50 %	88608833
111	NC_007798	TGG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608833
112	NC_007798	GGA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608833
113	NC_007798	CTG	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608833
114	NC_007798	TA	3	6	5779	5784	50 %	50 %	0 %	0 %	88608833
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116	NC_007798	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608833
117	NC_007798	AAC	2	6	5866	5871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608833
118	NC_007798	TTGA	2	8	5880	5887	25 %	50 %	25 %	0 %	88608833
119	NC_007798	A	6	6	5926	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	88608833
120	NC_007798	T	6	6	5971	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	88608671
121	NC_007798	CCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608671
122	NC_007798	TCT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608671
123	NC_007798	CAA	2	6	6048	6053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608671
124	NC_007798	GCA	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608671
125	NC_007798	AG	3	6	6096	6101	50 %	0 %	50 %	0 %	88608671
126	NC_007798	ATC	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
127	NC_007798	GAC	3	9	6129	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608671
128	NC_007798	TCA	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
129	NC_007798	CA	3	6	6142	6147	50 %	0 %	0 %	50 %	88608671
130	NC_007798	GTT	2	6	6215	6220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608671
131	NC_007798	ATA	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608671
132	NC_007798	TA	3	6	6335	6340	50 %	50 %	0 %	0 %	88608671
133	NC_007798	ATC	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
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135	NC_007798	AAG	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608802
136	NC_007798	TA	3	6	6694	6699	50 %	50 %	0 %	0 %	88608802
137	NC_007798	GA	3	6	6725	6730	50 %	0 %	50 %	0 %	88608802
138	NC_007798	TAG	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608802
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402	NC_007798	ATA	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608498
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